ГІДРОФІЛЬНІ АМІНОКИСЛОТИ
До гідрофільних відносяться амінокислоти, що містять в бічному ланцюзі карбоксильную або аміногрупу. Обидві ці групи при фізіологічних значеннях pH іонізовані.
Аспарагінова і глутамінова кислоти - кислі амінокислоти, лізин і аргінін - сильно основні, а гістидин - слабо основна амінокислота. Кільцева структура в молекулі гистидина називається імідазольним кільцем.
Аспарагінова і глутамінова амінокислоти в білках представлені також і своїми амидами - аспарагін і глутамін.
До гідрофільних відносяться також гидроксилсодержащий амінокислоти:
Цистеїн, як і серин, містить тіольний групу -SH замість гідроксильної ОН. Його специфічна роль в білках двояка: завдяки цистеїну в активні центри білків можуть бути введені тіольний групи, а два залишку цистеїну в білках можуть з'єднуватися ковалентним зв'язком -SS-.
Пролин примітний тим, що його залишок викликає злам пептидного ланцюга. На відміну від інших амінокислот вільний пролин містить не амино-, а іміногрупи.
ВИЗНАЧЕННЯ ЕЛЕКТРИЧНОГО ЗАРЯДУ АМІНОКИСЛОТИ ПО КРИВІЙ ТИТРУВАННЯ
Амінокислоти - амфотерні електроліти (амфоліти) мають властивості як кислот, так і основ. На підставі положень фізичної хімії, амінокислоти належать до слабких електролітів і в водних розчинах в залежності від pH середовища несуть на собі різний заряд відповідно до рівняння рівноваги (константи рівноваги К а , К А2 і K aR ):
І, як видно з табл. 3.1, бічні функціональні групи ряду амінокислот також мають кислотно-основними властивостями: р K aR - це константа кислотності для бічного ланцюга амінокислоти, що має функціональні групи з кислотно-основними властивостями. Наприклад, в бічному ланцюзі глутамінової кислоти є функціональна група -СООН, для якої за певних умов характерно кислотно-основну рівновагу
Електричний заряд на функціональній групі визначається співвідношенням між значеннями р До а цієї групи і pH розчину, описуваних рівнянням Гендерсона-Гассельбаха (2.4). Кожна здатна до іонізації група амінокислоти може перебувати в одному з двох станів - зарядженому або нейтральному. Анион СОО- володіє основними властивостями (приймає іон Н + ), а катіон NH 3 + - властивостями кислоти (віддає іон Н + ).
Значення pH, при якому амінокислота знаходиться в розчині тільки у вигляді цвіттер-іона (сумарно електрично нейтральна), називають ізоелектричної точкою (ВЕТ) амінокислоти. У ВЕТ розчинність амінокислот мінімальна, і в електричному полі постійного струму амінокислоти залишаються нерухомими. В з- електричному стані амінокислоти володіють підвищеною щільністю, високою точкою плавлення (понад 200 ° С). Розчини амінокислот мають більш високу діелектричної постійної, ніж вода, причому максимум значення досягається в ВЕТ. Значення pH в ізоелектричної точці (pi) для моноамінокарбо- нових кислот (кислоти, у яких бічні ланцюги не мають функціональних груп, здатних до іонізації, іншими словами, не містять аміно- і карбоксильних груп) можна визначити наступним чином: р! = (К а + К а г) / 2.
Таблиця 3.1
Характеристика амінокислот 1
Найменування |
Скорочення, прийняті в літературі |
Коротка характеристика хімічних властивостей бічних ланцюгів |
рК а бік. ланцюгів |
Примітка |
|
гліцин * |
Gly |
G |
Виступає в ролі простого сполучної ланки в ланцюзі білка |
Бере участь в синтезі креатину, пиррола, в знешкодженні ряду отруйних речовин |
|
Амінокислоти з вуглеводневими бічними ланцюгами |
|||||
аланин * |
Ala |
A |
Служать для гидрофобной стабілізації білка і для формування центрів свя- зиванія в ферментах |
||
валін ** |
Val |
V |
|||
лейцин ** |
Leu |
L |
|||
ізолейцин ** |
lie |
1 |
Є ще один хіральний центр |
||
ароматичні амінокислоти |
|||||
фенілаланін ** |
Phe |
F |
Здатний утворювати гідрофобні зв'язку і ефективно зв'язуватися з іншими плоскими молекулами |
||
Тирозин * (з фенілаланіну) |
Tyr |
0 |
Здатний утворювати гідрофобні зв'язку і ефективно зв'язуватися з іншими плоскими молекулами |
- 10,1 |
Концентрується в тканинах щитовидної залози |
триптофан ** |
Trp |
W |
Здатний утворювати гідрофобні зв'язку і ефективно зв'язуватися з іншими плоскими молекулами |
||
Амінокислоти - спирти |
|||||
Серін * |
Ser |
S |
ОН група має дуже слабкі кислотні властивості |
- 13,6 |
|
треонін ** |
Thr |
T |
Закінчення табл. 3.1
Найменування |
Скорочення, прийняті в літературі |
Коротка характеристика хімічних властивостей бічних ланцюгів |
P До бік. ланцюгів |
Примітка |
||
Амінокислоти з кислими властивостями бічних ланцюгів |
||||||
аспарагінова кислота * |
Asp |
D |
При нейтральних pH карбоксильні групи диссоційовані |
~ 3,9 |
Відіграє важливу роль в процесах обміну |
|
глутамінова кислота * |
Glu |
E |
4.3-4,7 |
|||
Амінокислоти з основними властивостями бічних ланцюгів |
||||||
лізин ** |
Lys |
До |
Гнучка бічний ланцюг з реакційно здатної аминогруппой на кінці |
- 10,5 |
||
аргінін ** |
Arg |
R |
Гуанідініевая група протоновану |
-12,5 |
Arg багаті ядра клітин, а також білки зростаючих тканин (ембріональна тканина, пухлини) |
|
гістидин ** |
His |
H |
Основна група несе позитивний заряд і може служити акцептором протона |
-6,1 |
||
Аміди аспарагінової і глутамінової кислот |
||||||
аспарагин * |
Asn |
N |
Амідна група не володіє кислотними властивостями, але полярна і може брати участь в утворенні водневих зв'язків | |||
глутамин * |
Gin |
Q |
Зустрічається у всіх тканинах організму у вільному стані |
Серосодержащіе амінокислоти |
|||||
метіонін ** |
Met |
М |
СН 3 в організмі бере участь в метилировании різних з'єднань |
||
Цистеїн * (з метіоніну) |
Cys |
З |
Мимовільно окислюється в присутності О2 з утворенням «подвійний амінокислоти» - цистину |
- 10,3 |
Кератин волосся багатий цією амінокислотою |
Кислота, що містить іміно- замість аміногрупи |
|||||
пролин * |
Pro |
[р |
Бічна ланцюг замикається на аміногрупу |
||
* - амінокислоти, синтезовані організмом. ** - амінокислоти, що надходять в організм тільки з їжею. |
1 Якщо невідомо, яка амінокислота варто в бічному ланцюзі білка - аспарагін або аспарагінова кислота, ис товують позначення Asx або В. У разі глутаміну або глутамінової кислоти застосовується Glx або Z.
Зони буферного дії у амінокислот дуже малі. Значення рКаі рК а2 , pi для амінокислот визначають, як правило, методом потенціометричного титрування. На рис. 3.1 представлена типова крива титрування амінокислоти.
Мал. 3.1. Крива титрування амінокислоти
Значення рК а й рК а2> рК а я, pi для кожної амінокислоти індивідуальні. У табл. 3.2 представлені значення цих параметрів для деяких амінокислот.
Значення pK al , рК а2 , р K aR , pi для деяких амінокислот
Таблиця 3.2
амінокислота |
P ^ i |
Р KaR |
Pi |
|
аспарагінова кислота |
1,99 |
9,90 |
3,90 |
3,0 |
глутамінова кислота |
2,10 |
9,47 |
4,07 |
3,2 |
цистеїн |
1,92 |
10,70 |
8,37 |
5,1 |
тирозин |
2,20 |
9,21 |
10,46 |
5,7 |
Г істідін |
1,80 |
9,33 |
6,04 |
7,6 |
лізин |
2,16 |
9,06 |
10,54 |
9,7 |
аргінін |
1,82 |
8,99 |
12,48 |
10,8 |
аланин |
2,35 |
9,87 |
6,02 |
|
глутамин |
2,17 |
9,13 |
||
гліцин |
2,35 |
9,78 |
||
Серін |
2,19 |
9,21 |
||
лейцин |
2,33 |
9,74 |
||
треонін |
2,09 |
9,10 |
||
аспарагин |
2,14 |
8,12 |
||
валін |
2,29 |
9,74 |
||
пролин |
1,95 |
10,64 |
З даних, наведених в табл. 3.2, видно, що буферними властивостями при значеннях pH, близьких до pH крові і міжклітинної рідини, володіє практично тільки одна амінокислота - гістидин, так як для неї величина р K aR = 6,04. Це властивість гистидина в організмі використовується наступним чином: гемоглобін характеризується високим вмістом гістидину, що дуже важливо для створення високої буферної ємності при pH, близькою до 7, для перенесення кисню і вуглекислого газу. Зони буферного дії амінокислот дуже малі.
Амінокислоти при значеннях pH, що відрізняються від значення їх pH в ВЕТ (pi), несуть сумарний електричний заряд, який в залежності від pH може бути як позитивним, так і негативним. При будь-якому значенні pH, що перевищує значення pi, сумарний заряд молекули негативний, і в електричному полі вона рухається в сторону позитивного електрода {анода). Відповідно при pH нижче значення pi молекула амінокислоти несе позитивний заряд і в електричному полі рухається до катода. Чим більше значення pH відрізняються від значення pi, тим більший сумарний заряд несе молекула і тим вище швидкість її руху до електрода. Дані властивості молекул амінокислот широко використовуються для їх розділення і аналізу в сумішах, наприклад, методами електрофорезу і ионнообменной хроматографії.
Для поділу застосовують препаративні методики одержання відносно великих кількостей чистого матеріалу, який може бути в подальшому використаний для різних цілей.
Для аналізу застосовують аналітичні методики, спрямовані на контроль якості, визначення складу суміші компонентів, визначення їх заряду і т. П.